Dengan terus meningkatkan kualitas dan mutu pendidikan, secara keseluruhan kini Universitas Iskandarmuda memiliki 5 (lima) Fakultas dengan 13 pilihan Program Studi yang terdiri dari Strata Satu dan Pascacarjana. Kelima fakultas dan pascasarjana serta jurusan dan program studi tersebut adalah :
1. Fakultas Ilmu Sosial & Ilmu Politik (S1)
- Program Studi Ilmu Administrasi Negara (S1)
- Program Studi Ilmu Komunikasi (S1)
- Program Studi Ilmu Sosiatri (S1)
- Magister Ilmu Administrasi (S2)
2. Fakultas Teknik (S1)
- Program Studi Teknik Sipil (S1)
- Program Studi Teknik Mesin (S1)
- Program Studi Teknik Elektro (S1)
3. Fakultas Pertanian (S1)
- Program Studi Agroteknologi (S1)
4. Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (S1)
- Pendidikan Guru Sekolah Dasar (PGSD) (S1)
- Pendidikan Matematika (S1)
- Pendidikan Bahasa Inggris (S1)
5. Fakultas Syariah & Ekonomi Islam (S1)
- Hukum Keluarga Islam (S1)
- Perbankan Syariah (S1)